1895年，德国物理学家伦琴在在维尔茨堡大学发现了X射线，因此他成为诺贝尔物理学奖的第一人。其次，还有14名诺贝尔奖获奖者在维尔茨堡大学做过研究和教学，他们从维尔茨堡大学走向世界。

人文科学、法律和经济、生命科学、自然科学和技术是维尔茨堡大学最具优势的四个学科专业领域。维尔茨堡大学学术地位一直处于德国大学的首要位置，在生物、医学、物理学和心理学等学科领域保持着国际水准。该校杰出的学术地位还表现在德国研究基金会DFG资助的大量的合作研究中心、研究训练组和研究单位，因为最终获得该基金会的资金支援是需要在激烈的竞争中胜出的。

维尔茨堡大学的研究成果一直以来影响和改变着世界，学校在本国的和国际研究机构及专家委员会的排名也证实了这一点，该校始终处于全球大学排名的100名之内，在欧洲大学排名的30名之内，在德国高等教育发展中心的评价排名中，维尔茨堡大学的心理学、生物学、化学、物理学、日耳曼语言文学和数学始终居于榜首位置。维尔茨堡大学的许多场所和建筑散布于整个城市，经过多年的发展，校园内形成了几个中心区域，比如位于Grombühl区的医学院校区、位于Dallenberg的植物系以及最主要的Hubland 校区等。由于历史悠久，许多建筑物都是历史遗迹，而许多课程就是在这些建筑中进行的，法学院就设在市中心经过整修的老校原址，大量保留下来的19世纪学院机构遗址更是学校悠久历史的见证。但是这并不意味着维尔茨堡仅仅是古旧的，在Hubland校区，充满现代结构和设施的艺术中心、计算机科技大楼、体育中心和生物中心等建筑使历史与现代得以再次和谐共存，该校因此成为德国最具吸引力的地方之一。

对学校的发展有着决定性作用的是60年代末开始把一系列科系迁出了狭窄的市区，建立新型的研究所和科研中心。比如1969年数学系迁移至Hubland，发展的高潮出现在1993年-1995年之间，先后建立了一个适应尖端科技需要的生物研究中心，一个高度现代化的微型结构实验室，一个具有世界领先水平的医院。该医院仅2005年一年就获得德国联邦教育与研究部（BMBF)6650万欧元（约合6亿人民币）的资金支持用于生物医学研究中心和感染分子生物学研究所的扩建。2006年该校入围德国评选的十大精英大学。入选精英大学资助计划的学校平均每校每年获得投资约1350万欧元，总计约19亿欧元。